Une alimentation riche en aliments fermentés augmente la diversité des microbes intestinaux et diminue les signes moléculaires d'inflammation, selon de nouvelles recherches.

Dans un essai clinique, 36 adultes en bonne santé ont été assignés au hasard à un régime de 10 semaines comprenant des aliments fermentés ou riches en fibres. Les deux régimes ont eu des effets différents sur le microbiome intestinal et le système immunitaire.

Manger des aliments tels que le yaourt, le kéfir, le fromage cottage fermenté, kimchi et d'autres légumes fermentés, boissons à base de saumure végétale et thé kombucha ont entraîné une augmentation de la diversité microbienne globale, avec des effets plus forts à partir de portions plus importantes.

"C'est une découverte étonnante", déclare Justin Sonnenburg, professeur agrégé de microbiologie et d'immunologie à la Stanford University School of Medicine. "Cela fournit l'un des premiers exemples de la façon dont un simple changement de régime alimentaire peut remodeler de manière reproductible le microbiote dans une cohorte d'adultes en bonne santé."

De plus, quatre types de cellules immunitaires ont montré moins d'activation dans le groupe des aliments fermentés. Les niveaux de 19 protéines inflammatoires mesurés dans des échantillons de sang ont également diminué. L'une de ces protéines, interleukine 6, a été liée à des conditions telles que la polyarthrite rhumatoïde, le diabète de type 2 et le stress chronique.

"Les régimes alimentaires ciblés sur le microbiote peuvent modifier l'état immunitaire, offrant une voie prometteuse pour réduire l'inflammation chez les adultes en bonne santé", explique Christopher Gardner, professeur et directeur des études de nutrition au Stanford Prevention Research Center. "Ce résultat était cohérent chez tous les participants à l'étude qui ont été affectés au groupe d'aliments fermentés les plus élevés."

En revanche, aucune de ces 19 protéines inflammatoires n'a diminué chez les participants soumis à un régime riche en fibres, riche en légumineuses, graines, grains entiers, noix, légumes et fruits. En moyenne, la diversité de leurs microbes intestinaux est également restée stable.

«Nous nous attendions à ce que la teneur élevée en fibres ait un effet bénéfique plus universel et augmente la diversité du microbiote», explique Erica Sonnenburg, chercheuse scientifique principale en sciences fondamentales de la vie, en microbiologie et en immunologie. « Les données suggèrent qu'un apport accru en fibres à lui seul sur une courte période est insuffisant pour augmenter la diversité du microbiote. »

De nombreuses preuves ont démontré que l'alimentation façonne le microbiome intestinal, ce qui peut affecter le système immunitaire et la santé globale. Selon Gardner, la faible diversité du microbiome a été liée à l'obésité et au diabète.

"Nous voulions mener une étude de validation de principe qui pourrait tester si les aliments ciblés sur le microbiote pourraient être un moyen de lutter contre l'augmentation écrasante des maladies inflammatoires chroniques", a déclaré Gardner.

Les chercheurs se sont concentrés sur les fibres et les aliments fermentés en raison de rapports antérieurs sur leurs bienfaits potentiels pour la santé. Alors que les régimes riches en fibres ont été associés à des taux de mortalité plus faibles, la consommation d'aliments fermentés peut aider au maintien du poids et peut réduire le risque de diabète, de cancer et de maladies cardiovasculaires.

Les chercheurs ont analysé des échantillons de sang et de selles prélevés au cours d'une période de pré-essai de trois semaines, les 10 semaines du régime et une période de quatre semaines après le régime lorsque les participants mangeaient comme ils l'avaient choisi.

Les résultats brossent un tableau nuancé de l'influence de l'alimentation sur les microbes intestinaux et le statut immunitaire. D'une part, ceux qui ont augmenté leur consommation d'aliments fermentés ont montré des effets similaires sur la diversité de leur microbiome et leurs marqueurs inflammatoires, conformément à des recherches antérieures montrant que des changements à court terme dans l'alimentation peuvent altérer rapidement le microbiome intestinal. D'autre part, le changement limité du microbiome au sein de la riche en fibres groupe concorde avec les rapports précédents des chercheurs d'une résilience générale du microbiome humain sur de courtes périodes de temps.

Les résultats montrent également qu'une plus grande consommation de fibres a conduit à plus de glucides dans les échantillons de selles, indiquant une dégradation incomplète des fibres par les microbes intestinaux. Ces résultats sont cohérents avec d'autres recherches suggérant que le microbiome des personnes vivant dans le monde industrialisé est appauvri en microbes dégradant les fibres.

« Il est possible qu'une intervention plus longue ait permis au microbiote de s'adapter de manière adéquate à l'augmentation de la consommation de fibres », explique Erica Sonnenburg. « Alternativement, l'introduction délibérée de consommateur de fibres des microbes peuvent être nécessaires pour augmenter la capacité du microbiote à décomposer les glucides.

En plus d'explorer ces possibilités, les chercheurs prévoient de mener des études chez la souris pour étudier les mécanismes moléculaires par lesquels les régimes alimentaires modifient le microbiome et réduisent les protéines inflammatoires. Ils visent également à tester si les aliments riches en fibres et fermentés agissent en synergie pour influencer le microbiome et le système immunitaire des humains. Un autre objectif est d'examiner si la consommation d'aliments fermentés diminue l'inflammation ou améliore d'autres marqueurs de santé chez les patients atteints de maladies immunologiques et métaboliques, ainsi que chez les femmes enceintes et les personnes âgées.

« Il existe de nombreuses autres façons de cibler le microbiome avec des aliments et des suppléments, et nous espérons continuer à étudier comment différents régimes, probiotiques et les prébiotiques ont un impact sur le microbiome et la santé de différents groupes », explique Justin Sonnenburg.

L'étude apparaît dans Cellule.

Le soutien pour le travail est venu de dons au Center for Human Microbiome Research; Paul et Kathy Klingenstein; la Fondation de la Main ; Heather Buhr et Jon Feiber; Meredith et John Pasquesi ; les instituts nationaux de la santé ; une bourse postdoctorale du doyen de Stanford ; une bourse d'études supérieures de la National Science Foundation; et un financement de démarrage de l'Institute for Immunity, Transplantation and Infection et du Sean N. Parker Center for Allergy and Asthma Research.

La source: L'Université de Stanford