D'autres études sur les bactéries intestinales et la santé

Une nouvelle étude, réalisée en regroupant les données de la plupart de ces études, jette l'eau froide sur l'idée que les kilos en trop peuvent provenir d'un déséquilibre des bactéries à l'intérieur de nous.

En fait, l'étude publiée dans la revue MBIO Il n'y a pas de caractéristique commune claire des populations de microbes, ou microbiomes, dans les systèmes digestifs des personnes obèses qui les différencie des microbiomes de ceux qui ont un poids santé.

Ce manque d'une «signature» claire parmi plus de 1,000 bénévoles dans 10 des plus grandes études réalisées à ce jour peut ne pas plaire aux personnes en surpoids. Cela peut également décevoir les entreprises qui leur vendent des produits visant à modifier la population microscopique de l'intestin à l'aide de fibres, de nutriments et de «bonnes» bactéries.

Pourtant, selon les chercheurs de l'Université du Michigan Medical School, cette découverte est réellement excitant. Cela signifie qu'il y a beaucoup plus de complexité - et donc beaucoup plus à apprendre - quand il s'agit de la relation entre notre microbiome et notre santé.

Les chercheurs ont créé un site en ligne ouvert où d'autres chercheurs peuvent voir comment ils ont fait ce qu'ils ont fait, et ajouter plus de données provenant d'études sur le microbiome intestinal chez les personnes obèses et non-obèses pour continuer la recherche de liens.

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À mesure que d'autres données seront ajoutées, la fiabilité des résultats ne fera que croître. Et peut-être des liens et des signatures spécifiques seront-ils trouvés à l'avenir.

Marc Sze, le chercheur postdoctoral qui a publié l'analyse avec le professeur de microbiologie Patrick Schloss, dit que l'ampleur du problème de l'obésité signifie qu'il est beaucoup plus important d'être certain de la science.

"L'obésité est actuellement un risque pour la santé de proportions épidémiques, et beaucoup ont suggéré que le microbiome bactérien est non seulement différent entre obèses et non obèses, mais peut également prédire l'obésité", dit Sze. "Nous voulions voir si c'était vraiment ce que suggérait la littérature existante, car ces affirmations pourraient avoir un impact positif sur la gestion de cette épidémie si elle était vraie".

Schloss ajoute: «En fin de compte, nous avons constaté qu'il n'y a pas de signatures claires ou de prédicteurs d'obésité à travers les données de microbiome rapportées jusqu'à présent, et que s'il y a une signature liée à la diversité des microbes, elle n'est pas biologiquement utile. C'est une mise en garde qui souligne la nécessité de faire plus de travail pour clarifier ce que nous savons et ne savons pas. "

Outils open-source

L'idée que l'obésité et les microbiomes déséquilibrés sont liés a commencé avec la recherche sur les animaux, et l'observation que les animaux obèses avaient tendance à avoir un certain rapport entre deux groupes d'espèces de bactéries. Cela a conduit à des études chez l'homme - certaines d'entre elles avec quelques dizaines de participants - qui ont fait les gros titres ces dernières années.

Mais les gens et les rongeurs élevés en laboratoire sont très différents, et de grands échantillons de personnes sont nécessaires pour dire quelque chose de définitif sur la santé humaine et son lien avec le microbiome.

Sze et Schloss ont utilisé des outils de calcul automatique développés dans le laboratoire de Schloss au cours des dernières années pour effectuer l'analyse. Cela incluait un programme appelé mothur qui donne aux chercheurs du microbiome un outil libre et gratuit pour étudier la grande quantité de données qui peuvent émerger des études sur le microbiome.

Ils ont créé un modèle de classification qui prend en compte toutes les données sur les différentes espèces de microbes présentes dans le microbiome d'un individu, ainsi que d'autres informations. Ils ont ensuite essayé de l'utiliser pour prédire si cette personne était obèse ou non.

Alors que l'outil fonctionnait quelque peu quand il l'utilisait sur les données d'une des études 10 réalisées par d'autres, il ne prédisait plus du tout l'obésité quand il l'utilisait sur les données des autres études.

"Il n'y a pas vraiment de microbiome" sain "", explique Schloss. "Vous pourriez regarder des centaines de personnes et ils pourraient tous avoir des populations très différentes de microbes dans leurs tripes. Donc, l'idée que nous pouvons corriger votre microbiome en faisant une chose simple ne tient pas non plus. "

Cela dit, les habitudes alimentaires généralement acceptées qui donnent aux microbes intestinaux beaucoup de fibres et de nutriments à mâcher ne peuvent pas nuire, ajoute-t-il.

Cancer du colon

L'équipe développe un outil similaire pour évaluer les liens possibles entre le microbiome intestinal et le cancer du côlon. Plus tôt cette année, ils ont publié des résultats d'une analyse de plusieurs centaines de personnes, et ont montré que leur outil possède une précision raisonnable pour détecter les signatures de microbiome qui sont plus fréquentes chez les personnes atteintes de cancer du côlon que celles sans.

"Nous continuerons à appliquer ces approches pour examiner le microbiome et le cancer colorectal", a déclaré Sze. "Nous voulons également tirer les leçons que nous avons tirées de travailler avec de grands ensembles de données et les appliquer à notre recherche sur la façon dont le microbiome bactérien dans les familles pourrait avoir un impact sur les cancers colorectaux héréditaires."

En fin de compte, l'objectif de ce travail pourrait être un nouvel outil de diagnostic pour détecter le cancer du côlon ou le risque de cancer d'un échantillon de selles.

Un autre domaine potentiel d'étude n'est pas la diversité des microbes présents dans l'intestin, mais plutôt la mesure dans laquelle ils produisent les produits de dégradation de leur rôle dans le processus digestif. Ces molécules, appelées métabolites, peuvent former une signature plus significative de l'activité microbienne.

Quoi qu'il en soit, dit Schloss, l'important dans tout travail sur le microbiome est de ne pas prendre des résultats initiaux excitants comme dernier mot.

"Nous devons faire avancer la science et réfléchir plus sérieusement aux résultats que nous obtenons", dit-il de tous les scientifiques du microbiome. "Il est nécessaire de procéder à une validation croisée et de comprendre que nous pourrions obtenir des résultats différents avec des populations différentes."

Les National Institutes of Health ont financé l'étude.

La source: Université du Michigan

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