Des boyaux sains pullulent de bugs, que font-ils alors?
La composition exacte du microbiote de chaque personne est aussi unique que leurs empreintes digitales. The Conversation, CC BY-ND

Le corps humain en bonne santé grouille de micro-organismes. Ils habitent tous les coins et recoins de la surface de notre corps. Mais de loin la plus grande collection de micro-organismes réside dans notre tube digestif - notre intestin.

 Quel est le microbiome humain?

Notre microbiote est constitué de ces minuscules organismes, visibles à l’aide d’un microscope. La combinaison du microbiote, des produits qu’elle fabrique et de son environnement de vie s'appelle le microbiome.

Les progrès considérables réalisés dans les technologies de séquençage de l’ADN nous ont permis d’étudier le microbiote intestinal en détail. Nous pouvons maintenant recenser tous les micro-organismes présents dans le microbiote afin de nous aider à comprendre ce qu’ils font.

Notre microbiote intestinal se compose généralement de plusieurs milliers de types de bactéries, ainsi que d’autres microbes tels que les virus et les levures. Certains types seront en abondance, alors que d'autres seront rares.


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La composition exacte du microbiote de chaque personne est aussi unique que leurs empreintes digitales. Mais contrairement aux empreintes digitales, le microbiote évolue constamment.

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Les microbes commencent à coloniser nos intestins et notre peau dès notre naissance. Le mode de naissance, naturel ou par césarienne, détermine le type de microbes avec lesquels un bébé entre en contact. Ce peut avoir un effet profond sur le développement précoce des populations microbiennes qui contribuent au microbiote.

De minuscules organismes commencent à coloniser l'intestin dès notre naissance. (Des tripes en bonne santé fourmillent d'insectes)
De minuscules organismes commencent à coloniser l'intestin dès notre naissance.
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La structure du microbiote - c'est-à-dire quels microbes sont présents et les nombres relatifs de chaque type - subit des changements importants depuis son établissement à la naissance jusqu'à sa maturité au début de l'adolescence.

Chez les adultes en bonne santé, les changements dans le temps seront probablement minimes. Mais des changements importants dans la composition peuvent se produire lorsque nous modifions radicalement notre régime alimentaire ou prenons des antibiotiques, qui sont bien sûr conçus pour tuer les bactéries.

Il a également été constaté que, comme notre propre corps, la composition de notre microbiote changements dans la vieillesse, y compris une perte de diversité.

Notre microbiote n'est pas un passager à chargement libre vivant dans notre intestin et volant les nutriments de notre nourriture. Au fil des millénaires, nous avons évolué avec notre microbiote. Nous savons maintenant que cela peut affecter de nombreux aspects de notre biologie, de notre système digestif à notre fonction cérébrale.

La façon dont notre corps se développe et fonctionne est dictée par nos gènes. On a approximativement les gènes 20,000 codés dans notre matériel génétique.

Les différents microbes qui composent notre microbiote ont leurs propres gènes. De manière approximative, les différents types de microbes 2,000 peuvent porter en moyenne chacun des gènes 3,000. Cela signifie que le microbiote contient six millions de gènes. Bien que beaucoup aient des fonctions similaires, cela indique que le microbiote a un complément génétique beaucoup plus complexe = que nous-mêmes.

Ce complément génétique du microbiote signifie qu’il peut faire des choses que d’autres parties du corps ne peuvent pas. Notre microbiote fournit des enzymes digestives qui nous permettent d’utiliser des aliments que nous ne pourrions pas digérer autrement. Il fournit des vitamines essentielles que nous ne pouvons pas fabriquer nous-mêmes. Et il interagit avec nos systèmes hormonaux et neuronaux pour aider à façonner notre physiologie.

Le plus important peut-être, c'est de développer notre système immunitaire pour lutter contre les insectes. Le corps doit être en mesure de faire la distinction entre les membres bénéfiques du microbiote en bonne santé et les micro-organismes pathogènes envahissants pouvant provoquer des maladies. Le système immunitaire doit apprendre à vivre avec le microbiote et à le nourrir tout en combattant les agents pathogènes.

Le microbiote contribue au développement de notre système immunitaire. (Des tripes en bonne santé fourmillent d'insectes)
Le microbiote contribue au développement de notre système immunitaire.
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La perturbation de l'interaction correcte entre le microbiote et le système immunitaire peut être l'une des causes de l'augmentation massive des maladies liées au système immunitaire, telles que le diabète, les allergies alimentaires, la polyarthrite rhumatoïde et les maladies inflammatoires de l'intestin.

Beaucoup de ces maladies semblent être des maladies de la richesse, probablement influencées par mauvais régimes et propreté excessive, affectant l'établissement précoce d'un microbiote approprié.

La connexion intime entre l'hôte et le microbiote et la riche contribution que chacun apporte au partenariat ont abouti au concept de métaorganisme. Cela reconnaît qu'en tant qu'êtres humains, nous sommes vraiment le produit de la coopération mutuelle entre notre propre corps et notre microbiote.

En effet, notre microbiote est si important et possède des fonctions tellement spécifiques qu'il est raisonnable de le considérer comme un autre organe de notre corps. C'est tout aussi important que notre foie ou nos reins.

A propos de l'auteur

Robert Moore, professeur de recherche en biotechnologie, responsable du laboratoire Interactions hôte-microbe, Université RMIT

Cet article est republié de The Conversation sous une licence Creative Commons. Lis le article original.

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